中國科學院植物研究所標本館的歷史可追溯到1928年成立的北平靜生生物調查所植物部標本室(PE)。經過80多年的建設，目前館藏臘葉標本逾260萬號(其中模式標本1.7萬餘份)，為亞洲最大的植物標本館。

依託本館主持承擔的《中國高等植物圖鑑》、(秦仁昌)蕨類植物分類系統、《中國植物誌》等三項成果獲得國家自然科學一等獎，同時為《Flora of China》、《Flora of Pan-Himalayas》等一系列科學鉅著的編研、植物學科的發展和科學傳播做出了重要貢獻。

目前標本收藏主要有：模式標本、臘葉標本、種子標本、植物化石標本、植物DNS標本、中國植物影象庫，使用者可以通過植物名稱來搜尋中國植物誌裡面的植物資料。