日本長崎大學是一所綜合型國立大學，前身始於1857年荷蘭海軍軍醫開辦的醫學傳習所，大學在研究中既注重建立面向世界的研究中心，又堅持發展立足於長崎本地的研究，併兼顧發展其他特色的研究專案。

長崎大學目前擁有8個學部和4個大學院，校園分為文教校區、片淵校區、阪本校區1、阪本校區2共四個部分，擁有9000名學生（包括以亞洲為主的來自世界40個國家的400名留學生），3000名教職員工。