臺灣圖書館的古籍與特藏文獻是自1990年代後期起致力於以數位典藏方式儲存重要文化資產。本館為掌握散佚海外重要中文善本古籍文獻，逐年調查海外各國中文善本古籍文獻存藏及數位典藏現況，以互惠合作方式，建置「中文古籍聯合目錄」資料庫，至2016年底止，已有超過76所國內、外機構參與本計畫，總計收有逾73萬筆目錄。

在諸多珍藏特藏資料中，以宋、元、明、清善本為主，總計寫本、刻本凡12,000餘部，近13萬冊。近8千部之刻本中，宋版175部、金版5部、元版230部、明版6,000多部，嘉興大藏經1部，其餘為活字版，清代以及朝鮮、日本、安南流傳較稀之刻本。如以冊計算，善本古籍加上普通線裝書古籍，約有善本舊籍中文260,760
冊、西文4,296冊，合計265,056冊。至2016年底統計，其中宋元本珍籍約400餘部。除此之外，本館所藏6,000多部明版書，以及明清稿本和批校本古籍，更為海內外學界所推重，咸認為是研究中華古文化重要資產。

這批珍藏，除了具有史料價值外，也具有版本、藝術鑑賞的特色;無論從版式到行款、文字到影象、字型到墨色、鈐印到題款、紙張到裝幀，都反映出古人對版本、印刷、裝幀等工藝美學的追求與堅持。在內容方面，館藏中文善本古籍亦有以下特點:

1、網羅昔日著名藏書樓、藏書家精品，既可探知明代文化風貌，更為研究明代史籍提供許多佐證。

2、同一名家著述，往往蒐集若干不同版本，足資學者校勘。

3、同一書相同版本常藏有數部，經過對照，凡書賈作偽，即易確定。

4.、明代文集和史料最為豐富，《千頃堂書目》、《四庫全書總目》所未著錄的，不在少數。

本館自1990年啟動文獻資訊化後，有鑑於館藏古籍的價值性與重要性，遂由特藏文獻組訂定計畫，除持續進行文獻整理與建置數位化。2002年國家型數位典藏計畫(後發展為「數位典藏與數位學習國家型科技計畫」)啟動後，為進一步便利學者運用國圖特藏資源，自2003年又陸續建置進行古籍數位化與古籍數位化國際合作計畫，包括「古籍影像檢索系統」、「中文古籍聯合目錄」、「金石拓片檢索系統」、「家譜聯合目錄」、「標點善本題跋集錄」等系統，為日後全文檢索進行前置作業。

2013年國圖又將前述系統整合為「古籍與特藏文獻資源」資料庫。透過平臺提供使用者瀏覽及檢索、本館古籍數位典藏各項服務。至2016年底為止，系統所收詮釋資料(或稱後設資料metadata)計有771,650筆，另外古籍影像約6,528,494葉、金石拓片影像21,076幅。為嘉惠學界，本系統所收之影像已於2017年1月18日正式對外開放，並採臺灣CREATIVE
COMMONS (姓名標示─非商業性─禁止改作3.0)，祈使文化傳播更為便捷，擴展臺灣漢學研究資源。

在建構目錄資料庫之同時，本館針對國內古籍研究資源無法取得部分全文影像之缺憾，尋求海外古籍數位化合作單位，利用臺灣卓越數位化技術與經驗，建立國際互惠合作模式。現階段已完成與美國國會圖書館、華盛頓大學圖書館、加拿大多倫多大學圖書館、法國國家圖書館、柏克萊加州大學圖書館的數位化作業。

已完成的合作單位中，北美地區以美國國會圖書館為主，其收藏善本約3,500部最為大宗，包括宋元版11部、太平天國書10種、永樂大典41冊及明人個人文集226種，其餘尚有若干罕見的稿本，另藏中國方誌2,939部，家譜400餘部，以上全部近7,000種;而版本自宋迄清初，其中以明代奏議、文集具有價值。

另該館所藏明清地方史料及清版古籍也頗有特色，同為政治、社會、經濟、文學以及地方史研究的重要史料。美國華盛頓大學圖書館所藏罕見的錢謙益遺著及其他清季善本詩文集、洛克所藏之中國西南地方誌、華大館藏明版書錄等。柏克萊加州大學館藏宋元刻及嘉業堂藏書。多倫多大學圖書館館藏宋元明清重要善本古籍。法國國家圖書館則以藏小說戲曲古籍相關資料，甚具研究價值。